工業機器人系統故障最常見的有兩種：一種是系統軟件故障，另一種是應用軟件故障。系統軟件包括數據管理、I/O通訊、系統初始化、補償計算與插補運算等內容。應用軟件主要面向具體工藝、由工程師編制的零件加工程序。系統軟件和用戶軟件它們的故障表現形式也不盡相同。

工業機器人系統軟件的故障，往往是由于工程師設計錯誤而引起的，可能在軟件設計的時候，對系統功能考慮不周到，設計目標構思不夠完整，讓系統軟件出現故障。對于這類軟件故障可通過更新軟件版本的方法來修正。一般情況下，新版本的軟件功能多，還有對軟件缺陷修正的功能。

工業機器人應用軟件故障，主要由人為因素產生，在用戶程序設計方面出現錯誤。如：語法、書寫格式或程序結構上。如未充分了解加工的過程或系統功能考慮不周。也可能在程序的傳送與保存過程中，使程序的內容發生變化，造成運行時出現故障。這類故障隨著操作者對數控系統的不斷熟悉可以逐漸減少。這些錯誤的產生，主要是在編寫程序或在程序輸入過程中造成的。

系統軟件和應用軟件故障。這些故障的產生，可能是由于對系統功能了解不詳細，或者在輸入編程錯誤引起的。只要工程師們在設計時稍加注意，這些系統故障都是可以避免的。